ลำไส้ใหญ่และทวารหนัก ลำไส้ใหญ่ไม่ได้รับการเปลี่ยนแปลงมากนักตามอายุ ไส้ตรงขยายใหญ่ขึ้นบ้าง อาการท้องผูกกลายเป็นเรื่องปกติมากขึ้น (ดูอาการท้องผูก สิ่งจำเป็นสำหรับผู้สูงอายุ ) ซึ่งมีสาเหตุมาจากหลายปัจจัย การเคลื่อนไหวของเนื้อหาผ่านลำไส้ใหญ่ช้าลงเล็กน้อย ระบบย่อย  การหดตัวของไส้ตรงลดลงเล็กน้อยเมื่อเต็มไปด้วยอุจจาระ การใช้ยาบ่อยขึ้นซึ่งอาจทำให้ท้องผูกได้ มักจะออกกำลังกายหรือออกกำลังกายน้อยลง อุ้งเชิงกรานอ่อนแอในสตรีสูงอายุ ความอ่อนแอของอุ้งเชิงกรานในสตรีสูงอายุสามารถทำให้เกิดภาวะกลั้นอุจจาระไม่ได้ความชราสามารถส่งผลอย่างมากต่อการทำงานของระบบย่อยอาหาร หนึ่งในนั้นคือความอยากอาหารลดลงเนื่องจากการเปลี่ยนแปลงของการผลิตฮอร์โมนและการเปลี่ยนแปลงของกลิ่นและรสชาติ การเปลี่ยนแปลงทางสรีรวิทยาของทักษะการใช้คอหอยและการเคลื่อนไหวของหลอดอาหารอาจนำไปสู่การกลืนลำบากและกรดไหลย้อน ในลำไส้ มีปัจจัยหลายอย่างที่ส่งผลต่อการเปลี่ยนแปลงของจุลินทรีย์ในลำไส้